Pembunuhan tersebut berlaku di banda Taxila, 25 kilometer barat Islamabad pada Selasa.
Pegawai polis tempatan, Naeem Abbas berkata, Danish Ali, 20, berang dengan tindakan kakaknya, Asifa Noreen, 32, seorang guru yang tetap membuang undi walaupun dilarang.
"Berdasarkan laporan yang dibuat bapa mangsa, Ali menembak Noreen dengan pistol miliknya di kediaman mereka dan anak perempuannya itu mati serta merta di tempat kejadian," kata Abbas dipetik AFP.
Polis masih mencari Ali yang melarikan diri sejurus selepas kejadian.
Insiden kejadian wanita yang dibunuh kerana mengundi jarang berlaku, walaupun sebelum ini beratus-ratus wanita Pakistan dibunuh setiap tahun dalam kes-kes keganasan rumah tangga atau atas alasan mempertahankan maruah keluarga.
Sementara itu, The Aurat Foundation yang merupakan kumpulan yang berperanan membela nasib kaum wanita di Pakistan berkata, lebih 3,000 wanita dibunuh dalam kes serangan sejak tahun 2008.